Сегодня ГКБ им. С.П. Боткина оснащена современной базой лечебной и диагностической медицинской техники, позволяющей оказывать специализированную медицинскую помощь различного профиля. Квалифицированный медицинский персонал применяет передовые методы лечения с использованием высокотехнологичного медицинского оборудования.
В настоящее время ГКБ им. С.П. Боткина представляет собой крупное медицинское объединение с общим коечным фондом, превышающим 2300 койко-мест. Больница располагает стационаром для оказания специализированной медицинской помощи, в т.ч. высокотехнологичной, по хирургическому, гинекологическому, терапевтическому, нейрохирургическому, травматологическому и другим профилям.
В Боткинской больнице в настоящее время работают 4300 сотрудников, в том числе 1100 врачей. Только на основной базе больницы трудятся 34 профессора и доктора медицинских наук, более 200 кандидатов медицинских наук, 13 врачей удостоены звания “Заслуженный врач Российской Федерации”. Практически каждый второй врач имеет высшую квалификационную категорию. Более 400 сотрудников расположенных на территории больницы кафедр, НИИ и медицинских центров, также работают в её отделениях, в их числе 36 профессоров и 56 доцентов.
Уникальная особенность больницы заключается в том, что, почти все её отделения являются клинической базой ведущих учебных и научно-исследовательских учреждений Москвы. На базе больницы размещены кафедры Российской медицинской академии последипломного образования, Первого московского государственного медицинского университета им. И.М. Сеченова, Российского национального исследовательского медицинского университета им. Н.И. Пирогова, Московского государственного медико-стоматологического университета им. А.И. Евдокимова, а также подразделения НИИ общей реаниматологии им. В.А. Неговского РАМН и Научного центра акушерства, гинекологии и перинатологии им. академика В.И. Кулакова.